バカボンのパパさん、こんばんわ。

クリーン電源はそれ自体が電源ラインにノイズを放出しますので壁コンセント側、つまりクリーン電源の手前にアイソレーショントランスを挿入するのが効果的です。

ですが、アイソレーショントランスはかなり巨大な容量を持った精度の高いトランスを使用していない限り、音の鈍りが避けられません。
音楽が生き生きしなくなって抑え付けられたような感じになったのはこのためだと思います。
どう折り合いをつけるか、難しい問題ですね。

クリーン電源の後、つまり機器とクリーン電源の間にアイソレーショントランス入れるのはノイズカット的にも殆ど意味がありませんし、余計なトランスが介在する事で更に抑制感が増長されるだけなので止めて頂いた方が宜しいかと思います。