Nboxプラスさん
初めましてzappa1993と申します。

私も車で音楽をよく聴きますのでカーオーディオの音質は気になります。
RD-3は消磁器ですので、CD以外にも磁性体の物に用いれば消磁効果は発揮されます。
光ケーブルはガラスやプラスチックが主なので、帯磁はしないと思いますが、塗料や被膜・シールドなどに磁性体が混じっていることもありますので、RD-3で消磁すると良い結果が得られるかもしれません。
またイオン照射（RIO-5?のことでしょうか？）は程度の差はあれ何に対してでも効果を発揮するように思いますので、光ケーブルにも有効ではないかと思います。
カーオーディオでもライン・電源ケーブルには銅線が使われていますので、これらを消磁するのも効果的だと思います。

ご質問には関係ありませんが、QR-8という水晶チップをカーオーディオやバッテリーに貼ることで振動を抑え音質が良くなると思いますので、興味がおありでしたらこれも貸し出しを利用するなどして是非お試しください。

以上、参考になりましたら幸いです。